More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2718 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  88.51 
 
 		 148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  87.16 
 
 		 148 aa  278  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  87.84 
 
 		 148 aa  278  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  86.49 
 
 		 148 aa  276  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  86.49 
 
 		 148 aa  275  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  80.41 
 
 		 148 aa  262  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  52.86 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  42.5 
 
 		 208 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 		 199 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  44.54 
 
 		 204 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  38.4 
 
 		 203 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  40 
 
 		 208 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  41.94 
 
 		 208 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  41.94 
 
 		 208 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  40 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  33.58 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  35.88 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  34.71 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  33.33 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  30.99 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  31.54 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  32.31 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.23 
 
 		 586 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.79 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.94 
 
 		 863 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  31.86 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  34.68 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  33.65 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.7 
 
 		 282 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  30.65 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.06 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  28.03 
 
 		 897 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  33.68 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  29.69 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.83 
 
 		 626 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.69 
 
 		 600 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.26 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  33.64 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 605 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  36.15 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  33.05 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.55 
 
 		 688 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.34 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25.38 
 
 		 589 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.58 
 
 		 859 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  33.04 
 
 		 601 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  28.89 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 688 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  30.08 
 
 		 641 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  32.08 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 615 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 615 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  28.8 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.54 
 
 		 875 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 615 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 615 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 615 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 623 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  31.58 
 
 		 637 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.23 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  31.85 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  31.03 
 
 		 324 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  31.03 
 
 		 324 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  27.01 
 
 		 625 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.11 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.57 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 606 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  25.2 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  30.66 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>