More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0804 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
129 aa  261  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  77.52 
 
 
129 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  75 
 
 
130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  56.45 
 
 
129 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  42.86 
 
 
208 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  42.86 
 
 
208 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 
204 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  36.67 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  31.75 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  37.93 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  34.75 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  36.44 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  38.14 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  34.88 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  34.75 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.88 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  33.62 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  33.33 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  37.5 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  33.62 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  33.33 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  31.71 
 
 
213 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  32.48 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.62 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  32.56 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  37.5 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.33 
 
 
600 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  28.04 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.13 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  29.31 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  28.03 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.17 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  28.45 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  33.9 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.5 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  30.47 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  32.77 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  32.46 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  31.2 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  34.13 
 
 
282 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  32.23 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  32.52 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  29.69 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  29.69 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  31.41 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.77 
 
 
845 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.19 
 
 
586 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.43 
 
 
191 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  32.52 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.86 
 
 
223 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
208 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  32.26 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  29.5 
 
 
209 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  29.69 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32.54 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  25.93 
 
 
216 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.05 
 
 
613 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  27.21 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  29.66 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  29.69 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  31.01 
 
 
144 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.89 
 
 
185 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.46 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.09 
 
 
165 aa  50.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.45 
 
 
649 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  31.93 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.57 
 
 
320 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>