More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1479 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  100 
 
 		 238 aa  464  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.57 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  27.87 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.52 
 
 		 313 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.56 
 
 		 291 aa  85.1  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  24.09 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  40.37 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  23.9 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 129 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  24.36 
 
 		 320 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  34.45 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  35.2 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  26.87 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  32.06 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.89 
 
 		 1560 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.4 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.22 
 
 		 837 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  32.82 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  23.66 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  33.33 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  35.45 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  25.56 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  23.19 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.18 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1731  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  26.27 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  38.53 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  31.15 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  25.99 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  24.1 
 
 		 279 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  25.86 
 
 		 280 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.06 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  30.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  26.75 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  35.96 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  33.91 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.36 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  30.17 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  25.15 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.19 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  33.81 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  25.36 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  24.64 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  25.81 
 
 		 845 aa  58.5  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 643 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.36 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  30.65 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25.58 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  25.57 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.71 
 
 		 877 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.46 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.38 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  25.35 
 
 		 646 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  28.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.54 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  24.9 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  30.48 
 
 		 120 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  28.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  23.67 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.38 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.19 
 
 		 1665 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.08 
 
 		 605 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  27.83 
 
 		 187 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  27.83 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  27.55 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>