More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0486 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  100 
 
 		 258 aa  500  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  49.19 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  28.21 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.09 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  32.46 
 
 		 313 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 313 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  30.94 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  31.87 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  30.37 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  31.58 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  28.26 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  28.92 
 
 		 426 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  34.43 
 
 		 153 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  37.12 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  35.9 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  29.74 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  35.96 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.59 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  28.19 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.13 
 
 		 845 aa  72.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  26.97 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.88 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.33 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  29.69 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.14 
 
 		 769 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.04 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  36.07 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.03 
 
 		 877 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30.36 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.31 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  38.28 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  27.15 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  29.85 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  32.48 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.32 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  36.21 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  32.84 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  36.07 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  28.11 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 141 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  27.43 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  26.05 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.86 
 
 		 865 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.68 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  35.09 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.05 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  38 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  37.72 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.91 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  26.49 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  32.37 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.76 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.72 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  38.68 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>