More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0488 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  62.63 
 
 
283 aa  364  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  50.72 
 
 
283 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  49.64 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  49.26 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  49.82 
 
 
287 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  46.49 
 
 
280 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  46.26 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  33.21 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  35.74 
 
 
284 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1489  CBS domain containing protein  34.8 
 
 
283 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  33.94 
 
 
281 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0294  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
282 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0293568  normal  0.263236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  32.49 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.02 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  25.61 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  29.9 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  28.19 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.19 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  33.96 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.06 
 
 
688 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.57 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
215 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  36.13 
 
 
877 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.69 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.94 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.03 
 
 
482 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  26.29 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.03 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.42 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  37.39 
 
 
859 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  27.67 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  36.64 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  36.64 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  36.64 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
688 aa  65.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  28.03 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.01 
 
 
138 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.11 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  36.22 
 
 
153 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 
141 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  33.64 
 
 
502 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.11 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  37.29 
 
 
216 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  25.77 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  26.34 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.95 
 
 
493 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.79 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
145 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
147 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.76 
 
 
158 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  31.47 
 
 
153 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  34.65 
 
 
219 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.65 
 
 
153 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 
155 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 
381 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  31.53 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
154 aa  62.4  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
162 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  29.82 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.8 
 
 
862 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  25.82 
 
 
433 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  34.38 
 
 
220 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 
688 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.4 
 
 
503 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  26.56 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 
152 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  34.21 
 
 
488 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  27.65 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.62 
 
 
493 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  32.22 
 
 
139 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  28.45 
 
 
145 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.96 
 
 
484 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 
139 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.1 
 
 
152 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  26.11 
 
 
224 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 
120 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
153 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.87 
 
 
484 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 
493 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  31.75 
 
 
147 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  37.5 
 
 
863 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  30.28 
 
 
147 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.96 
 
 
484 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.36 
 
 
487 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  32.09 
 
 
154 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  26.72 
 
 
144 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>