161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0294 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0294  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
282 aa  548  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0293568  normal  0.263236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  60.64 
 
 
283 aa  343  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  62.77 
 
 
281 aa  343  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1489  CBS domain containing protein  61.13 
 
 
283 aa  331  7.000000000000001e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  60.42 
 
 
284 aa  329  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  33.8 
 
 
282 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  35.04 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  33.8 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  35.09 
 
 
287 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
283 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 
272 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  36.07 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  32.39 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  33.72 
 
 
280 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.92 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  25.34 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.63 
 
 
315 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  33.06 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  21.72 
 
 
399 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.22 
 
 
386 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  25.5 
 
 
411 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.85 
 
 
132 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24.71 
 
 
412 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  25.08 
 
 
427 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 
279 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  24.9 
 
 
413 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.1 
 
 
675 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.1 
 
 
413 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.69 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  25.73 
 
 
379 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.46 
 
 
769 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  28 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35.94 
 
 
867 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  25.31 
 
 
381 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  29.17 
 
 
292 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
262 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.46 
 
 
211 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  31.01 
 
 
688 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  32.46 
 
 
502 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.26 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  48.15 
 
 
490 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.12 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  30.97 
 
 
500 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  29.6 
 
 
503 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.65 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.2 
 
 
612 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.96 
 
 
903 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
230 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 
149 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.01 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  24.89 
 
 
423 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.2 
 
 
605 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  27.94 
 
 
145 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  31.19 
 
 
138 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  27.83 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.62 
 
 
185 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.25 
 
 
580 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 
394 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  30 
 
 
154 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  22.45 
 
 
411 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
159 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
143 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.02 
 
 
903 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.96 
 
 
907 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  26.96 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  30.43 
 
 
502 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  30.08 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.72 
 
 
888 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  46.81 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
688 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  27 
 
 
511 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  26.43 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
624 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
366 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  30.51 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.26 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  43.64 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  32.89 
 
 
460 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
141 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1384  CBS domain protein  25.19 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.81 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  30.28 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  30.38 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  34.26 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  23.65 
 
 
384 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  25.6 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>