More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1898 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  78.46 
 
 
261 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  77.31 
 
 
262 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  68.48 
 
 
275 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  56.86 
 
 
512 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  52.73 
 
 
268 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  51.17 
 
 
268 aa  255  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  48.44 
 
 
260 aa  245  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  44.6 
 
 
288 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2843  CBS domain containing protein  48.02 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  45.68 
 
 
264 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  44.49 
 
 
266 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0666  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1290  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.382555 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1386  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 
264 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  44.14 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  31.18 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.46 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  35.71 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  39.45 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
153 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.29 
 
 
580 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
859 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28.8 
 
 
875 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.2 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  35.05 
 
 
437 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
145 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  30.16 
 
 
139 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  31.06 
 
 
155 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  36.21 
 
 
380 aa  59.3  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.87 
 
 
227 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
143 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.28 
 
 
863 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  35.05 
 
 
435 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  35.23 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  35.42 
 
 
438 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  34.09 
 
 
437 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.37 
 
 
139 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.27 
 
 
859 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  34.09 
 
 
437 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  29.46 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.01 
 
 
883 aa  56.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  29.46 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  29.46 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  24.48 
 
 
148 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  32.95 
 
 
437 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  29.06 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.23 
 
 
504 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.66 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  33.33 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.08 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  30 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  30.33 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.17 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  33.71 
 
 
434 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 
155 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  24.39 
 
 
145 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  29.73 
 
 
377 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
432 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
378 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  30.25 
 
 
394 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
150 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.5 
 
 
147 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.17 
 
 
873 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.32 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.51 
 
 
485 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.79 
 
 
482 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.79 
 
 
482 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
225 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.21 
 
 
495 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 
141 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  28.68 
 
 
149 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  30.84 
 
 
859 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.46 
 
 
485 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
144 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
225 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28 
 
 
877 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.64 
 
 
489 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  28.19 
 
 
160 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  39.29 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  34.23 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.03 
 
 
491 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  23.58 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>