More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1719 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  296  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  73.43 
 
 		 143 aa  233  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  44.53 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  50 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  43.07 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  43.8 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  45.99 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  45.19 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  43.7 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  42.22 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  42.96 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  42.22 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  42.22 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  42.22 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  42.22 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  40.74 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  39.26 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  40 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  39.26 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  39.26 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  39.26 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  37.78 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  35.94 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 131 aa  93.2  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  32.28 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.79 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.83 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  28.03 
 
 		 494 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.97 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 493 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.74 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.57 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.82 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.82 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 		 247 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 		 508 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  27.69 
 
 		 537 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 428 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.82 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 427 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.49 
 
 		 483 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.8 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  34.92 
 
 		 909 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  30.77 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  32.79 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.61 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  27.46 
 
 		 427 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.11 
 
 		 903 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  24.24 
 
 		 491 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 		 261 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 256 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.21 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  27.21 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  28.46 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  28.06 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.14 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  25.85 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  25.69 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  27.4 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  31.15 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  24.54 
 
 		 483 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  25.2 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.76 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.63 
 
 		 483 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  26.24 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  25.85 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  25.71 
 
 		 558 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.45 
 
 		 862 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.93 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  34.15 
 
 		 284 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.04 
 
 		 490 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  29.13 
 
 		 434 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.21 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  35.96 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  30.95 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.46 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 		 875 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>