More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1197 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  73.7 
 
 		 272 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  74.81 
 
 		 282 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  69.93 
 
 		 287 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  62.04 
 
 		 284 aa  348  6e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  49.08 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  46.49 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  43.01 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  34.57 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  33.94 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  32.12 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0294  putative signal transduction protein with CBS domains  32.95 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0293568  normal  0.263236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1489  CBS domain containing protein  28.83 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.85 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  40.54 
 
 		 688 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  28.49 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.15 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  33.08 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.583611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.45 
 
 		 141 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.86 
 
 		 877 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.65 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 867 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.86 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.34 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 		 863 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.8 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.06 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.73 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.11 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  34.09 
 
 		 859 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  36.46 
 
 		 875 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  35.05 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.66 
 
 		 865 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 873 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.88 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  33 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  27.72 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.55 
 
 		 145 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 223 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 		 863 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  34.02 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  27.92 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  23.99 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  38.46 
 
 		 769 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.55 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  35.16 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.34 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  38.71 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  35.11 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.2 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  35.11 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  40 
 
 		 120 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  32.12 
 
 		 149 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  38.71 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  33.33 
 
 		 140 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.33 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  38.37 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  33.86 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  37.11 
 
 		 859 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.86 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  40.21 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  36.67 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.95 
 
 		 873 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.71 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.77 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  32.22 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  31.06 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  36.44 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  25.56 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>