More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2607 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
384 aa  770    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  79 
 
 
381 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  67.79 
 
 
385 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  67.53 
 
 
398 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  63.42 
 
 
379 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  36.91 
 
 
411 aa  249  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  35.31 
 
 
407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  30 
 
 
411 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  23.64 
 
 
380 aa  99.8  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  26.1 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  29.43 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  28.84 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  28.84 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  21.48 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  39.86 
 
 
211 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  29.55 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  21.1 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.54 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  31.71 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  24.63 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  19.29 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.4 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  26.22 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.09 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30 
 
 
224 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  33.09 
 
 
226 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  27.05 
 
 
284 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
863 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  28.57 
 
 
280 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  22.89 
 
 
315 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  19.57 
 
 
279 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.92 
 
 
209 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
315 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  26.34 
 
 
283 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  26.56 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
863 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.84 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  26.42 
 
 
287 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
232 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.1 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
162 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  23.7 
 
 
285 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.23 
 
 
132 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 
219 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  31.19 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.04 
 
 
710 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  32.32 
 
 
138 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
256 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  36 
 
 
491 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  20.75 
 
 
271 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  28.48 
 
 
258 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  26.18 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  30.12 
 
 
143 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  25.57 
 
 
262 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  26.98 
 
 
883 aa  57.4  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.03 
 
 
873 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  24.85 
 
 
272 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  21.74 
 
 
282 aa  57  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  31.68 
 
 
511 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  30.77 
 
 
158 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25.54 
 
 
277 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
152 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  34.11 
 
 
463 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.55 
 
 
223 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28 
 
 
191 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  27.7 
 
 
148 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  24.92 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.38 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  37.8 
 
 
153 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  29.5 
 
 
144 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  32.04 
 
 
513 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  27.81 
 
 
769 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  21.84 
 
 
258 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  21.59 
 
 
250 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
139 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.43 
 
 
140 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.05 
 
 
873 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  24.43 
 
 
290 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.06 
 
 
185 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  38.75 
 
 
132 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 
149 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1815  signal-transduction protein  23.62 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 
675 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  31.07 
 
 
513 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  33.94 
 
 
170 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.7 
 
 
880 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.47 
 
 
279 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  35.87 
 
 
875 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  22.56 
 
 
238 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  28.8 
 
 
279 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
145 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  40 
 
 
234 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
139 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  31.53 
 
 
496 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  31.07 
 
 
513 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  32.12 
 
 
154 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>