189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1271 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  100 
 
 
285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  45.76 
 
 
282 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  33.46 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  28.52 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  27.44 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  27.42 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 
140 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  25.63 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  25.99 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
141 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
141 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  28.57 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  23.7 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  29.36 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  28 
 
 
136 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.47 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  21.97 
 
 
427 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  28.69 
 
 
490 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  23.79 
 
 
386 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.65 
 
 
487 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  32.06 
 
 
411 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  24.19 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  23.94 
 
 
487 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.73 
 
 
485 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  23.94 
 
 
487 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  31.78 
 
 
413 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.71 
 
 
486 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  23.33 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  31.54 
 
 
412 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  28.44 
 
 
141 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  26.22 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  28.1 
 
 
185 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.23 
 
 
413 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  23.38 
 
 
279 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  27.13 
 
 
615 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.04 
 
 
488 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  30.3 
 
 
513 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  32.2 
 
 
136 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.09 
 
 
188 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30 
 
 
513 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  26.14 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  25 
 
 
145 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  23.19 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
131 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  23.13 
 
 
436 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
252 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  22.45 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  22.18 
 
 
379 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  33.71 
 
 
492 aa  49.7  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.58 
 
 
482 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.58 
 
 
482 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  23.39 
 
 
626 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  26.45 
 
 
141 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  39.51 
 
 
859 aa  49.3  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  30.16 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  22.5 
 
 
187 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.09 
 
 
500 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  25.71 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  29.77 
 
 
143 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  30.97 
 
 
155 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  22.87 
 
 
426 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
136 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  29.75 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.82 
 
 
487 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  28.1 
 
 
155 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  29.17 
 
 
138 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.29 
 
 
513 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.06 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2688  CBS domain-containing protein  22.58 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.49 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0523  KpsF/GutQ family protein  26.85 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
137 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.03 
 
 
224 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30.7 
 
 
139 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  25.34 
 
 
158 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.68 
 
 
500 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
143 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  30.1 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  26.6 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.46 
 
 
281 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  28.45 
 
 
139 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  22.36 
 
 
574 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.43 
 
 
487 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  29.03 
 
 
130 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
136 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  23.6 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  25.47 
 
 
128 aa  45.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.15 
 
 
490 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  25.49 
 
 
606 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  25.49 
 
 
606 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  23.98 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  24.43 
 
 
399 aa  45.8  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>