More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0416 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  100 
 
 
130 aa  258  3e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  76.15 
 
 
136 aa  203  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  55.91 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  42.5 
 
 
139 aa  105  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  42.86 
 
 
141 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  43.8 
 
 
135 aa  103  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  42.98 
 
 
126 aa  102  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.83 
 
 
138 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  40.34 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  41.18 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  43.55 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  40.34 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  42.4 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 
131 aa  93.2  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  38.79 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  40.68 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  41.32 
 
 
128 aa  91.3  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  36.97 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  37.93 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  38.21 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  37.5 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.66 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  39.66 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  39.06 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  44.54 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  44.54 
 
 
688 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  44.54 
 
 
688 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  41.8 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  36.72 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  42.28 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  42.86 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.17 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  34.4 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.5 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38.66 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.97 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.97 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.67 
 
 
574 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 
688 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  35.48 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  40.16 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  38.38 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.77 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.21 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  39.09 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  35.59 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  42.28 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.75 
 
 
626 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
485 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  31.2 
 
 
641 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  40.37 
 
 
689 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1344 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  37.29 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.36 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 
625 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.83 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.28 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  31.2 
 
 
627 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  32.5 
 
 
262 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.61 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  38.53 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1274 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  33.87 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  30.51 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 
250 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  41.43 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  34.15 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  41.77 
 
 
865 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  33.03 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  35.4 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  37.8 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  31.67 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  36.11 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  34.78 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0316  putative signal transduction protein with CBS domains  40.96 
 
 
576 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.03 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.5 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.09 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  37.14 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  26.05 
 
 
663 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  31.67 
 
 
574 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>