More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0979 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  100 
 
 
139 aa  283  8e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  72.66 
 
 
139 aa  206  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  69.78 
 
 
139 aa  204  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  74.82 
 
 
139 aa  189  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  58.68 
 
 
126 aa  160  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  50.41 
 
 
135 aa  141  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  44.85 
 
 
138 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  48.92 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  43.61 
 
 
138 aa  117  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  49.25 
 
 
143 aa  111  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  44.12 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  45.8 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  45.38 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  40.88 
 
 
139 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  46.76 
 
 
142 aa  103  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  38.64 
 
 
140 aa  103  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  42.42 
 
 
136 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  41.18 
 
 
145 aa  100  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  41.35 
 
 
141 aa  100  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  41.32 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  42.11 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  39.85 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  40.94 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  38.79 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  38.64 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.71 
 
 
141 aa  92  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  41.18 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  40.3 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  37.8 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  39.71 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  37.61 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  50 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  37.19 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  38.66 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.4 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  34.35 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
688 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  35.04 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.75 
 
 
688 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  32.61 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.67 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.51 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  38.1 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  30.25 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 
643 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  32.8 
 
 
646 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  34.19 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  29.51 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.01 
 
 
648 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  38.02 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.71 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  36.36 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.45 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  35.9 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  33.33 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.33 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
645 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  25.83 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  29.03 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
645 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
211 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  26.72 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  28.57 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.45 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  34.55 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  29.2 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
618 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.87 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  28.87 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  30.09 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  28.91 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.51 
 
 
1560 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  33.33 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 
485 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.89 
 
 
574 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>