More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0568 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  45.38 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  45.22 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 
688 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  40.17 
 
 
207 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  37.7 
 
 
688 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  37.19 
 
 
135 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.07 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.7 
 
 
185 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  38.05 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  36.28 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  37.39 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  38.18 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35.25 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
606 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  40 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.85 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  36.45 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  38.61 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  33.91 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  37.01 
 
 
250 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.45 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  37.6 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  36.04 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  36.04 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  36.04 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.92 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  36.04 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  37.6 
 
 
215 aa  72  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.14 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
598 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.8 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  33.61 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  30.25 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  34.43 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  36.84 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  33.61 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.7 
 
 
348 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  36.22 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.79 
 
 
188 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.29 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
615 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 
618 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
623 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  29.41 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
601 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  34.23 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.77 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  32.48 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  36.28 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
605 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  31.4 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  28.7 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  35.64 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  31.45 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.71 
 
 
626 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  30 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3697  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  28.95 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  28.7 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.71 
 
 
258 aa  66.6  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  34.21 
 
 
145 aa  66.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  29.51 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  28.33 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 
625 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  31.9 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
623 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  34.75 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  34.75 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
865 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  32.63 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>