More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1013 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  417  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  51.66 
 
 
232 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
214 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  38.68 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  38.68 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  38.68 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  38.68 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
214 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  38.68 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  38.68 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  38.21 
 
 
214 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  38.21 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  38.21 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  39.15 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  36.79 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  43.46 
 
 
216 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  39.91 
 
 
211 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  41.2 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  38.43 
 
 
215 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  42.22 
 
 
210 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  40.67 
 
 
223 aa  131  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  39.43 
 
 
208 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  37.09 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  39.17 
 
 
214 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  33.33 
 
 
220 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 
223 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  35.24 
 
 
214 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  42.2 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  39.51 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  40.43 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  38.1 
 
 
216 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  33.33 
 
 
224 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  37.93 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  35.33 
 
 
217 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  37.62 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  37.19 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  34.27 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.27 
 
 
210 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  40.52 
 
 
219 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  32.86 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  31.94 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 
145 aa  94.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
230 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  34.84 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  29.86 
 
 
222 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  34.97 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
225 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  32.86 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  46.83 
 
 
166 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  42.65 
 
 
225 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 
225 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30.11 
 
 
223 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  31.91 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  38.28 
 
 
143 aa  82  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.54 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 
136 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  40.14 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  37.19 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  38.28 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  39.55 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  37.69 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  32.41 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  46.4 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  39.34 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 
143 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  40.48 
 
 
769 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  43.2 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  43.2 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  43.2 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  31.76 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  40.65 
 
 
503 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.21 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  35.17 
 
 
152 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  33.1 
 
 
147 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  33.1 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.1 
 
 
145 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
482 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
845 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.46 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  44 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  37.1 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  34.85 
 
 
877 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  38.71 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  40 
 
 
496 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>