More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0831 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  284  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  66.19 
 
 		 172 aa  203  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  68.84 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  66.91 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  66.91 
 
 		 141 aa  199  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  66.91 
 
 		 141 aa  199  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 		 139 aa  200  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  69.34 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  66.91 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  66.19 
 
 		 141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  65.47 
 
 		 139 aa  190  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  64.23 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  33.58 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  30.88 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  33.09 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  30.37 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  33.81 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  33.81 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.58 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  30.15 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.75 
 
 		 487 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  33.59 
 
 		 502 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  32.35 
 
 		 426 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  27.74 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  31.54 
 
 		 490 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.2 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  32.37 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.06 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 873 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  32.31 
 
 		 579 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.41 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  27.01 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.15 
 
 		 313 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.74 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  30.3 
 
 		 500 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.85 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  28.99 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  26.47 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  28.77 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  30.83 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 		 640 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.01 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  28.47 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.46 
 
 		 427 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  26.15 
 
 		 511 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  27.01 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 383 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.52 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  28.68 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  32.58 
 
 		 503 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  29.23 
 
 		 488 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.03 
 
 		 230 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.23 
 
 		 513 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  27.69 
 
 		 217 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 282 aa  52  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 399 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.08 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  23.13 
 
 		 902 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  32.26 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  27.48 
 
 		 883 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 384 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 279 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  32.84 
 
 		 262 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  27.01 
 
 		 376 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  32.06 
 
 		 502 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 		 280 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.47 
 
 		 216 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>