105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2280 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  48.61 
 
 
217 aa  209  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  38.86 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  33.96 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.93 
 
 
209 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.55 
 
 
210 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
215 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
221 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.93 
 
 
214 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
256 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
223 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  31.43 
 
 
220 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
214 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.22 
 
 
208 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  34.21 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.38 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.2 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  34.38 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  34.57 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  30.81 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.98 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
216 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  36.21 
 
 
216 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.63 
 
 
216 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  33.17 
 
 
221 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.96 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  31.13 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  38.93 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  38.93 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  35.66 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  38.17 
 
 
144 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  31.9 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.79 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.38 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  25.94 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  25.94 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  25.94 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  25.94 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  38.94 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  25.94 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  25.94 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  26.05 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  25.78 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  30.23 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  27.83 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  29.1 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  27.43 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  25.77 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2131  CBS domain-containing protein  23.94 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  24.68 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 
162 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  31.93 
 
 
154 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  27.69 
 
 
258 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.68 
 
 
513 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  28.68 
 
 
513 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  25.62 
 
 
303 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  29.03 
 
 
131 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  27.91 
 
 
513 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  25.87 
 
 
152 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  28.67 
 
 
151 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  42.86 
 
 
147 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  27.53 
 
 
867 aa  45.1  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.6 
 
 
488 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  23.04 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.91 
 
 
845 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  28.21 
 
 
579 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.2 
 
 
888 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  26.36 
 
 
303 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.68 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.64 
 
 
482 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  25.58 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  26.02 
 
 
1560 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  25.41 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  28.04 
 
 
381 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  38.24 
 
 
393 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  26.36 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 
135 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  27.82 
 
 
226 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  23.44 
 
 
138 aa  42  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>