More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2010 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  65.41 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  63.04 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  61.7 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  62.59 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  45.38 
 
 		 209 aa  116  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 215 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 215 aa  110  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 221 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  39.53 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  40.31 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  38.17 
 
 		 214 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  38.35 
 
 		 219 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  42.19 
 
 		 210 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  39.84 
 
 		 210 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  42.31 
 
 		 216 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  38.17 
 
 		 256 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  42.31 
 
 		 216 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  36.17 
 
 		 215 aa  98.2  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  97.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  40.77 
 
 		 219 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.88 
 
 		 223 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  32.58 
 
 		 217 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  35.88 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  37.31 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  38.06 
 
 		 212 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  39.71 
 
 		 220 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.34 
 
 		 212 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  34.85 
 
 		 208 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  34.88 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  34.72 
 
 		 222 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.54 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  34.27 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  39.84 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0089  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.08 
 
 		 494 aa  67.4  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0800118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 217 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  30 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  30 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 485 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  30 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39730  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 		 489 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.58 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.53 
 
 		 485 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  31.06 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  27.52 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.39 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.62 
 
 		 486 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.39 
 
 		 494 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  29.1 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 532 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.74 
 
 		 426 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  28.57 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.92 
 
 		 489 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.73 
 
 		 497 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.59 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.85 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.91 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.46 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.19 
 
 		 497 aa  58.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.94 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.19 
 
 		 497 aa  58.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  26.53 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.59 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2497  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30 
 
 		 485 aa  57.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0704163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.17 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.13 
 
 		 489 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.61 
 
 		 485 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.48 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.45 
 
 		 888 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  29.85 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  33.33 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.09 
 
 		 485 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 		 620 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.06 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 427 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 386 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  33.09 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 505 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>