More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1533 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  42.47 
 
 
223 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  41.63 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  38.29 
 
 
256 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  36.53 
 
 
221 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  39.8 
 
 
219 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  36.7 
 
 
227 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  35.03 
 
 
217 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 
230 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  35.05 
 
 
230 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.7 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
232 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.15 
 
 
216 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  34.36 
 
 
220 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  29.56 
 
 
214 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.22 
 
 
211 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 
217 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.84 
 
 
209 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  31.19 
 
 
214 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.72 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.27 
 
 
219 aa  91.7  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  29.44 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.53 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.9 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  28.5 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.1 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  28.98 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  28.43 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  32.69 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  27.23 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  29.35 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  27.5 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  27.5 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  27.5 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  30.77 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  27.6 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  34.23 
 
 
152 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  32 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  31.34 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  30.81 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  30.6 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  30.6 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
321 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
321 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
144 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  37.67 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  33.83 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.87 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.73 
 
 
426 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  29.46 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  22.54 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.51 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.91 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.03 
 
 
166 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 
153 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.76 
 
 
153 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  35.97 
 
 
416 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.71 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
150 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  30 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.77 
 
 
250 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.2 
 
 
153 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 
427 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.2 
 
 
153 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.16 
 
 
137 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
137 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.93 
 
 
153 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  19.21 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  32.28 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.38 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  30.08 
 
 
513 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 
145 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 
149 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>