More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0937 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  458  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  48.02 
 
 
214 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  50.72 
 
 
216 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  42.08 
 
 
214 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
214 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  38.32 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  38.32 
 
 
214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  38.32 
 
 
214 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  37.85 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  37.85 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  37.85 
 
 
214 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  37.85 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  37.85 
 
 
214 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  37.85 
 
 
214 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  43.07 
 
 
216 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  38.51 
 
 
223 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  36.06 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  37.36 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  36.71 
 
 
209 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.81 
 
 
208 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  38.05 
 
 
210 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  33.33 
 
 
224 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  34.3 
 
 
221 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.83 
 
 
211 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  39.44 
 
 
214 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  31.13 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
215 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  36.79 
 
 
217 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  36.45 
 
 
223 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.04 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.78 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  38.96 
 
 
211 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  34.62 
 
 
208 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  31.51 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
230 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  45 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  44.38 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.88 
 
 
219 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 
223 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  34.48 
 
 
217 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  31.61 
 
 
221 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  36.26 
 
 
215 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  36.31 
 
 
212 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.12 
 
 
212 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  35.63 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  32.67 
 
 
202 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
145 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  34.56 
 
 
138 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  43.08 
 
 
166 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  42.22 
 
 
769 aa  89  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  34.97 
 
 
143 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  31.03 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  38.13 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  38.89 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  38.89 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  38.89 
 
 
146 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  34.78 
 
 
142 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
139 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  36.62 
 
 
142 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 
152 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
368 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.91 
 
 
907 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
873 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
865 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.65 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.15 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  33.58 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  36.23 
 
 
366 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  37.19 
 
 
845 aa  75.1  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  37.3 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 
139 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
162 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  37.21 
 
 
140 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.77 
 
 
139 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  36.59 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  36.76 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.82 
 
 
877 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.21 
 
 
605 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  34.96 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.85 
 
 
863 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.71 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  34.96 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>