More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1899 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 149 aa  292  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  34.9 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.77 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.38 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 256 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.8 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.11 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 		 500 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 250 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  36.57 
 
 		 386 aa  70.1  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  36.17 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 769 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  38.03 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.67 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 890 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 698 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  33.86 
 
 		 313 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  35 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  34.45 
 
 		 880 aa  67  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  32.76 
 
 		 303 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 215 aa  67  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  31.61 
 
 		 427 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  30.92 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 875 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 		 873 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.88 
 
 		 426 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  30.58 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.14 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  33.86 
 
 		 565 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.61 
 
 		 909 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.87 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 		 605 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.78 
 
 		 499 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  33.61 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  29.91 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.48 
 
 		 845 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 		 907 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  30.17 
 
 		 303 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 215 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  35.25 
 
 		 904 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  31.45 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  34.33 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.13 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.13 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  29.31 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.4 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  36.97 
 
 		 909 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.54 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  35 
 
 		 865 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35.83 
 
 		 867 aa  60.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  26.52 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  33.86 
 
 		 907 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 875 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.94 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.03 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.69 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.17 
 
 		 883 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  34.09 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.26 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.09 
 
 		 216 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  31.67 
 
 		 286 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  27.89 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  29.58 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  28.97 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.59 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.39 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  31.37 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  30.28 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.68 
 
 		 427 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 875 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  26.23 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  33.05 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.27 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.92 
 
 		 502 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.69 
 
 		 877 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>