More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2202 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  64.19 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  56.76 
 
 		 152 aa  188  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  56.46 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  57.14 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  53.02 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  54.73 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  43.92 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  43.84 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  42.57 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  42.28 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  40.14 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  42.76 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  39.19 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  44.44 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  38.62 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  38.78 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  38.51 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  39.58 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  36.25 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  36.6 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  34.87 
 
 		 243 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  35.62 
 
 		 249 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.95 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  35.53 
 
 		 243 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  36.24 
 
 		 246 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  35.57 
 
 		 247 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  38 
 
 		 243 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  34.69 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  33.78 
 
 		 242 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 		 246 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.65 
 
 		 223 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.87 
 
 		 243 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  34.01 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  36.42 
 
 		 201 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  34.93 
 
 		 242 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.14 
 
 		 229 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.55 
 
 		 242 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  33.79 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 		 219 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.61 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 242 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 230 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.15 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.87 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  33.99 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  39.31 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.45 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.87 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.21 
 
 		 227 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  39.31 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.17 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 384 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 384 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 		 241 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  30.61 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.17 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  37.93 
 
 		 215 aa  77  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 		 216 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.19 
 
 		 224 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  35.97 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  37.24 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.72 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  36.17 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.61 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.85 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  32.88 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.41 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  31.37 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.12 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.3 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.48 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 384 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>