More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3300 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  96.76 
 
 
216 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  52.31 
 
 
215 aa  215  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  50.93 
 
 
212 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  49.54 
 
 
212 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  46.6 
 
 
215 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  45.63 
 
 
215 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  47.4 
 
 
214 aa  164  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  47.4 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  46.67 
 
 
210 aa  157  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  50.62 
 
 
209 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  36.71 
 
 
223 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  43.6 
 
 
221 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  36.19 
 
 
224 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  37.93 
 
 
210 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  47.13 
 
 
211 aa  135  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  51.13 
 
 
145 aa  134  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  41.04 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  41.04 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  38.92 
 
 
223 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  34.8 
 
 
221 aa  125  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  41.29 
 
 
219 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  35.75 
 
 
230 aa  118  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  38.55 
 
 
219 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  41.01 
 
 
217 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  38.38 
 
 
227 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  37.2 
 
 
216 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  45 
 
 
232 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  33.7 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  45.99 
 
 
149 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  36.63 
 
 
202 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  46.27 
 
 
147 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  46.27 
 
 
147 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  35.51 
 
 
222 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 
144 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.64 
 
 
225 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  44.85 
 
 
225 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  43.79 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 
144 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.18 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  35.43 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 
162 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  35.55 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 
133 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 
217 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  42.86 
 
 
262 aa  88.6  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  38.78 
 
 
153 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.79 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  35.57 
 
 
154 aa  85.1  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  28.99 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  28.99 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  28.99 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  40.29 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.11 
 
 
149 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  33.53 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  38.58 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  39.84 
 
 
845 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.46 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.46 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  37.01 
 
 
153 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.42 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  35.17 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.21 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  36.36 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34.27 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  34.27 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.93 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 
152 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  38.35 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.86 
 
 
142 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  33.09 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  37.78 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  37.93 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  35.06 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  35.66 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  37.32 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  33.33 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.27 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.99 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>