More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1097 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  36.16 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  36.63 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  33.49 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.48 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.87 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  31.96 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  33.53 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  29.82 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.96 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 		 256 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32.21 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.9 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  34.34 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 223 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  33.33 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.09 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 145 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  26.11 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  38.06 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.55 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  27.85 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.57 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.95 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  28.9 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.65 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  24.63 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  29.51 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.81 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  28.95 
 
 		 149 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  30.07 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  30.07 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  26.24 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  26.7 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  23.39 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  23.39 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  23.39 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  23.39 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  24.77 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  23.39 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  23.39 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  23.39 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  23.39 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  26.05 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  23.39 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  24.64 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  27.59 
 
 		 494 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  22.94 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.14 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.44 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.08 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.47 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.01 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  27.09 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.47 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.27 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  27.18 
 
 		 532 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  25.41 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.8 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  29.17 
 
 		 507 aa  62.4  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39730  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.08 
 
 		 489 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.81 
 
 		 493 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  33.09 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.31 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.22 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.57 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.1 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.31 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.57 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.14 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.37 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.37 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  27.33 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  27.33 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>