More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0309 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  47.96 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  46.12 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  43.42 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  44.8 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  43.46 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  45.26 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  36.87 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  37.85 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  37.85 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  38.66 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  38.37 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  35.58 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  37.86 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  33.78 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  36.23 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  39.63 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  40 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  38.37 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.75 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  36.63 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  34.3 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  38.06 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  35.85 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.47 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  35 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.41 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.51 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.64 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 162 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 162 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.91 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  38.97 
 
 		 149 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  31.15 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  33.67 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  38.24 
 
 		 147 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 144 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 		 154 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.9 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  39.53 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 144 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  33.14 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  30.16 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  37.1 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  40.16 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  33.07 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.63 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.34 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  30.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  30.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  30.34 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.17 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  34.62 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.28 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32.35 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  29.21 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.29 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 		 688 aa  68.6  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  32.33 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.52 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2104  signal-transduction protein  30.15 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.81 
 
 		 845 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.38 
 
 		 867 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.77 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.58 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.9 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.48 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  29.32 
 
 		 490 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  30.32 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.82 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.47 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  31.5 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>