More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4194 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2660  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000716462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.76 
 
 		 487 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 		 486 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1031  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  98.98 
 
 		 489 aa  971    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.56 
 
 		 487 aa  730    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.96 
 
 		 489 aa  677    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.47 
 
 		 487 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.41 
 
 		 490 aa  714    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 490 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 		 488 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.51 
 
 		 489 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 487 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.14 
 
 		 488 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1449  inosine-5-monophosphate dehydrogenase  93.87 
 
 		 489 aa  882    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327774  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1431  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.5 
 
 		 489 aa  648    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  98.98 
 
 		 489 aa  971    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 		 515 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  70.84 
 
 		 490 aa  719    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  70.84 
 
 		 490 aa  719    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  94.07 
 
 		 489 aa  891    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.59 
 
 		 490 aa  711    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.03 
 
 		 487 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.06 
 
 		 491 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.65 
 
 		 487 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.69 
 
 		 486 aa  711    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1029  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  99.59 
 
 		 489 aa  976    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  71.46 
 
 		 486 aa  720    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.11 
 
 		 489 aa  905    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.06 
 
 		 487 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 		 487 aa  668    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 		 486 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.51 
 
 		 490 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 		 490 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.76 
 
 		 489 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 		 488 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.46 
 
 		 486 aa  725    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.98 
 
 		 487 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 		 486 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.14 
 
 		 488 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1589  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.42 
 
 		 485 aa  682    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.84 
 
 		 486 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1532  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.42 
 
 		 485 aa  681    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 		 488 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 		 488 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3008  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.86 
 
 		 491 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0175212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.1 
 
 		 489 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  77.87 
 
 		 556 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.4 
 
 		 487 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.66 
 
 		 486 aa  729    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2440  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.53 
 
 		 489 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.4 
 
 		 486 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 488 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1495  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.3 
 
 		 489 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.939383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.39 
 
 		 489 aa  702    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1285  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 		 486 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0259426  normal  0.434243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.59 
 
 		 490 aa  711    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.03 
 
 		 487 aa  682    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2704  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 		 487 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.62 
 
 		 488 aa  724    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 		 487 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.82 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2001  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.71 
 
 		 489 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.488937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.96 
 
 		 489 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  91.82 
 
 		 489 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 		 488 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2745  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00565207  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.84 
 
 		 486 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.73 
 
 		 487 aa  671    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.76 
 
 		 488 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.57 
 
 		 488 aa  739    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.21 
 
 		 488 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2876  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.62 
 
 		 485 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.61 
 
 		 486 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15310  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.96 
 
 		 489 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10306  hitchhiker  4.2499e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.43 
 
 		 514 aa  699    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.41 
 
 		 491 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1346  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.96 
 
 		 489 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.82 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.24 
 
 		 487 aa  678    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00905  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.92 
 
 		 485 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0297709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2767  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.55 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.61 
 
 		 486 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.61 
 
 		 486 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.4 
 
 		 486 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.76 
 
 		 488 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.35 
 
 		 489 aa  706    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.84 
 
 		 486 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  78.12 
 
 		 494 aa  771    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>