More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2208 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  61.9 
 
 
210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  53.81 
 
 
214 aa  232  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  52.38 
 
 
210 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 
215 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  40 
 
 
215 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  38.21 
 
 
220 aa  148  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  44.77 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  38.3 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  37.32 
 
 
209 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  38.86 
 
 
223 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  39.9 
 
 
214 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  43.6 
 
 
216 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  38.5 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  39.15 
 
 
215 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  38.83 
 
 
212 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
256 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  37.02 
 
 
223 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  34.3 
 
 
232 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  37.09 
 
 
216 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  37.57 
 
 
212 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.97 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  36.23 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  34.09 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  35.03 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  34.6 
 
 
217 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
145 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.82 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  32.54 
 
 
217 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  41.04 
 
 
144 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  37.76 
 
 
149 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.54 
 
 
214 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  39.55 
 
 
147 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.65 
 
 
221 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  39.55 
 
 
147 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  29.68 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.78 
 
 
224 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.85 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  30.33 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  30.33 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  30.33 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  30.33 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  30.33 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  30.33 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  30.33 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  30.33 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  30.86 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  29.86 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  26.29 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  28.17 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  29.52 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  28.43 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  33.99 
 
 
153 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.11 
 
 
142 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.95 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  29.87 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.47 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.12 
 
 
769 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.92 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.41 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  30.6 
 
 
331 aa  68.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.19 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  30.41 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  29.61 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.14 
 
 
152 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.46 
 
 
688 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
153 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  30.37 
 
 
140 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  30.92 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  34.13 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
688 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  30.83 
 
 
153 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>