More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2437 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  59.86 
 
 
169 aa  183  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  62.12 
 
 
149 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  59.09 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  43.36 
 
 
142 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  43.06 
 
 
143 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  40.15 
 
 
154 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  40.43 
 
 
142 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  39.72 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  36.43 
 
 
210 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  34.85 
 
 
214 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  34.56 
 
 
166 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  36.15 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.29 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.29 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.29 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.72 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
232 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.29 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  36.43 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  33.83 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  32.84 
 
 
640 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  34.59 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.62 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  32.81 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  33.09 
 
 
217 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
217 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.83 
 
 
216 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  34.17 
 
 
214 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  34.17 
 
 
214 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  34.17 
 
 
214 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  34.17 
 
 
214 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  34.17 
 
 
214 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30.15 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  33.88 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  34.35 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  31.11 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.14 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.6 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.88 
 
 
211 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  31.75 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
215 aa  66.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.99 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.66 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  31.78 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.62 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.4 
 
 
487 aa  65.5  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.63 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  31.06 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.07 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
769 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  30.16 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.29 
 
 
246 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  33.33 
 
 
220 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  29.23 
 
 
492 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  30.65 
 
 
282 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.19 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  27.46 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  30.33 
 
 
490 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>