More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0966 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  50.83 
 
 
315 aa  325  5e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  47.95 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 
313 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  41.46 
 
 
313 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  40.41 
 
 
315 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  41.45 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  39.07 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  42.16 
 
 
279 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  34.18 
 
 
279 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
279 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
279 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  31.94 
 
 
302 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.3 
 
 
250 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.21 
 
 
258 aa  90.9  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  27.57 
 
 
238 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  22.71 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  23.33 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.09 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  23.08 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  22.34 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  34.33 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  24.91 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  24.73 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.38 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24.56 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  23.84 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.03 
 
 
153 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  24.56 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.48 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.46 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.59 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.56 
 
 
146 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.56 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.56 
 
 
146 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.78 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.37 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  34.56 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.37 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  37.31 
 
 
223 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.85 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
636 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.59 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32 
 
 
863 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.17 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  27.95 
 
 
873 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  31.11 
 
 
164 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.33 
 
 
605 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  32.07 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.06 
 
 
216 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  27.18 
 
 
411 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 
225 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
877 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  29.85 
 
 
143 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.45 
 
 
161 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.17 
 
 
482 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
225 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.33 
 
 
224 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  35.38 
 
 
149 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 
150 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.86 
 
 
386 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.52 
 
 
153 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
385 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.06 
 
 
214 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  33.07 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  24.47 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 
863 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 
162 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  35.07 
 
 
208 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  27.54 
 
 
146 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  25.79 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  36.27 
 
 
143 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
208 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 
152 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
150 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 
136 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  33.52 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 
907 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  28.21 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  23.33 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  33.91 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  29.69 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  26.88 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.55 
 
 
489 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 
145 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 
143 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.37 
 
 
209 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>