More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2651 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 161 aa  314  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  58.49 
 
 		 160 aa  197  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  57.52 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  50.33 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  45.1 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  41.45 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  37.32 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  36.62 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.47 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.18 
 
 		 249 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.79 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.46 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.67 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  37.75 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  34.59 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.38 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.19 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  35.76 
 
 		 426 aa  70.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32.47 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32.47 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.61 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.07 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.07 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.75 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  28.67 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.42 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.61 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.26 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  28.67 
 
 		 615 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.61 
 
 		 615 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.61 
 
 		 615 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.88 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  28.92 
 
 		 242 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.22 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.77 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30.41 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  32.03 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.56 
 
 		 605 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.47 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  30.26 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.49 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.33 
 
 		 615 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 615 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.11 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.57 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.49 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  26.7 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.92 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.94 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.67 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.68 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  30.92 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.56 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  29.61 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.22 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.95 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  30.92 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  34 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.92 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  32 
 
 		 212 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  26.8 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  32.68 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  29.8 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.33 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  31.06 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 615 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.21 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>