More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2046 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2046  CBS  100 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  69.8 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  65.1 
 
 		 150 aa  215  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  53.38 
 
 		 151 aa  173  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  53.02 
 
 		 152 aa  173  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  54.73 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  56.76 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  37.58 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  40.82 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  34.9 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  34.27 
 
 		 152 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  34.97 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  34.46 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.51 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.66 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.89 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  36.81 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.81 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  32.64 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  32.64 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  34.27 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 		 242 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 246 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  35.53 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 230 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.21 
 
 		 158 aa  84.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  34.46 
 
 		 242 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 243 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  29.61 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  35.81 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.9 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  37.11 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  34.25 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.03 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.87 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 		 246 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  38.12 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.78 
 
 		 423 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 873 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  31.17 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.8 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.42 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.42 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.69 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  34.27 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.17 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.33 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.48 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.56 
 
 		 903 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.19 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  32.48 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.62 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.79 
 
 		 907 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  31.85 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.69 
 
 		 845 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  28.67 
 
 		 233 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 		 241 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  34.93 
 
 		 909 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  33.79 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.1 
 
 		 909 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  29.81 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.97 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.94 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26.85 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.86 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  31.97 
 
 		 416 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  34.25 
 
 		 877 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  32.41 
 
 		 904 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  29.61 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  23.97 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  30 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0119  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.851715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>