More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1925 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  37.84 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  37.58 
 
 
148 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 
150 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
151 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 
152 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  41.5 
 
 
153 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
149 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  35.81 
 
 
155 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  34.23 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.16 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  34.67 
 
 
160 aa  84.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.61 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.08 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.67 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.67 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.57 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  32.45 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.57 
 
 
234 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
609 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  33.57 
 
 
426 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  31.76 
 
 
391 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 
223 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.72 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  28.85 
 
 
232 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
634 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 
230 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.08 
 
 
191 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 
227 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.2 
 
 
246 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.28 
 
 
224 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 
252 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  27.81 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.73 
 
 
628 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  26.95 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.13 
 
 
339 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  28.08 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 
211 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
258 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  28.08 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  28.08 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.3 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 
229 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  31.08 
 
 
339 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.82 
 
 
230 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 
226 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  28.77 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 
247 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 
379 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  25.34 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 
219 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  27.27 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  26.9 
 
 
262 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  31.58 
 
 
333 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.62 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.35 
 
 
620 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  28.28 
 
 
261 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  23.57 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  24 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.28 
 
 
229 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.86 
 
 
577 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  26.32 
 
 
660 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  25.34 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.77 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.66 
 
 
880 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  23.08 
 
 
492 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  29.29 
 
 
502 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 
201 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  30.33 
 
 
683 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.92 
 
 
348 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  28.06 
 
 
502 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  30.82 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 
859 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 
251 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  25 
 
 
883 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  31.37 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.7 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  23.61 
 
 
513 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>