More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2232 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
164 aa  315  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  54.32 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  40.13 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
231 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.49 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.56 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  37.11 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.36 
 
 
230 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.38 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.59 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.52 
 
 
226 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
246 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.75 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  32.1 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  31.1 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.11 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.11 
 
 
385 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.28 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  26.54 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  31.52 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.7 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
385 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.1 
 
 
230 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.85 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  32.72 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.4 
 
 
242 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
246 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.87 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.32 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  30.13 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.22 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.01 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.29 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.7 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  32.3 
 
 
348 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  27.04 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.48 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  35.48 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.67 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.16 
 
 
242 aa  67.8  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.92 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  29.87 
 
 
907 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.19 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
137 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.86 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  32.68 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  31.41 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  30.49 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
373 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  32.47 
 
 
909 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  28.48 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.01 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  29.94 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.94 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  29.11 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  26.88 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  29.93 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  28.48 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  27.11 
 
 
368 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  33.11 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.38 
 
 
132 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.61 
 
 
903 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.57 
 
 
863 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 
404 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
224 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.39 
 
 
427 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.68 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.3 
 
 
426 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.69 
 
 
201 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  31.71 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.97 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.54 
 
 
769 aa  61.6  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  26.88 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  32.03 
 
 
133 aa  61.6  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 
863 aa  61.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30.12 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.22 
 
 
904 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  25.97 
 
 
875 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  30.32 
 
 
416 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 
225 aa  61.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  25.75 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>