More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1201 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  306  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  56.76 
 
 
152 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  59.46 
 
 
148 aa  178  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  53.33 
 
 
150 aa  176  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  53.02 
 
 
150 aa  173  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  52.7 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  52.35 
 
 
150 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  40.94 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  40.27 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 
149 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 
149 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  38.46 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 
147 aa  114  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
154 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.87 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  34.48 
 
 
153 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
150 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
153 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
153 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
152 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  33.57 
 
 
153 aa  100  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 
154 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  33.56 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.77 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  31.29 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.48 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  35 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
153 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 
230 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  35.37 
 
 
230 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.93 
 
 
249 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.33 
 
 
230 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
242 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  36.13 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.61 
 
 
223 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
241 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 
256 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
226 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.53 
 
 
246 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 
229 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  36.55 
 
 
223 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  35.14 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.14 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.45 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 
247 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
246 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.92 
 
 
229 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.87 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.61 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  35.95 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.28 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.64 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  28.67 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  35.21 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.52 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  33.77 
 
 
904 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  29.37 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.32 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  27.92 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  27.97 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.61 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.33 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  24.52 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.2 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  31.94 
 
 
217 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  34.27 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.19 
 
 
226 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  31.47 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  29.68 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 
428 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  25.66 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  32.89 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.65 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.94 
 
 
210 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.11 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30.67 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  26.39 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.69 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>