More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  100 
 
 		 191 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  40.64 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  40.64 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  40.64 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  36.08 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  33.68 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.94 
 
 		 246 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  40.94 
 
 		 132 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.65 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 226 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  31.94 
 
 		 243 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  38.1 
 
 		 141 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.05 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  36.29 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  37.88 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.04 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.3 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.25 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  39.32 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.73 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  34.69 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  34 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.09 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.24 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  32.16 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.13 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.8 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  32.03 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.17 
 
 		 845 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.7 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  36.07 
 
 		 907 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.28 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 688 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 155 aa  72  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 		 873 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.72 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  29.22 
 
 		 339 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  36.89 
 
 		 909 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31796  predicted protein  33.58 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.409273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35.04 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.29 
 
 		 903 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  27.78 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  36.51 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  27.78 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  27.19 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.89 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  42.02 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  36.51 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  27.31 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.54 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  36.59 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  30.89 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  35.25 
 
 		 404 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  35.71 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  30.83 
 
 		 313 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.52 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  28 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  36.89 
 
 		 909 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 124 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  41.8 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  35.34 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  37.4 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  38.4 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  36.29 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.8 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  38.4 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  31.34 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  38.4 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>