More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3439 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  777    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  97.14 
 
 		 385 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  43.46 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  47.06 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  43.01 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  43.27 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  43.01 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  42.01 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.65 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  42.35 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  42.9 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 		 391 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  39.89 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  37.93 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  38.56 
 
 		 399 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  36.41 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  36.73 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  38.67 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  39.19 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  40.11 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  39.27 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  38.02 
 
 		 465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  38.95 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  38.95 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  38.42 
 
 		 397 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  38.42 
 
 		 397 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  38.02 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  40.18 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  35.08 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  37.2 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  36.29 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  36.56 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  35.16 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  35.93 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  35.16 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.44 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  35.69 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  35.34 
 
 		 373 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  35.07 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  36.2 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  34.35 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  36.12 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  35.31 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  35.41 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  40.85 
 
 		 231 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  32.72 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  34.98 
 
 		 238 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  30.82 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  35.41 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  36.36 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.49 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  31.8 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  34.68 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  37.7 
 
 		 284 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  36.78 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  38.71 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.09 
 
 		 155 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  29.72 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.11 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 232 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  28.67 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.67 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  34.81 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  34.48 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 161 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  27.27 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  23.03 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 223 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.34 
 
 		 191 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 148 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 149 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  32.04 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 137 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  35.14 
 
 		 194 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  27.46 
 
 		 164 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>