More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0317 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 374 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  62.57 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  65.21 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  59.37 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  58.82 
 
 		 401 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  49.2 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  50 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  49.73 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  45.33 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  44.63 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  45.55 
 
 		 449 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  47.09 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  45.36 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  44.68 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  44.62 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  45.09 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  44.16 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  44.33 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  44.36 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  44.47 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  44.77 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  44.2 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  43.6 
 
 		 399 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  43.13 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  42.51 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  42.25 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  42.51 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  42.51 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  42.25 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  42.51 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  42.74 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 		 387 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  44.65 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  44.35 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  44.69 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  41.37 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  39.56 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  39.56 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  39.01 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  40.24 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  39.57 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  37.53 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  36.68 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  36.64 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  37.37 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  35.36 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  38.86 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  40.05 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  35.6 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  35.63 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  35.26 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  34.63 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  37.73 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  50.32 
 
 		 180 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  39.43 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  42.11 
 
 		 238 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  48.08 
 
 		 231 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  38.77 
 
 		 231 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  30.95 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  34.86 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 285 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  39.01 
 
 		 240 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36.23 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 180 aa  93.2  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  34.44 
 
 		 199 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  36.42 
 
 		 231 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.94 
 
 		 194 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  35.75 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0328  HPP family protein+B94  49.48 
 
 		 134 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00996185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  43.8 
 
 		 165 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  39.83 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  43.55 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  40.83 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  39.83 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.69 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  41.53 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  40.68 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  41.61 
 
 		 157 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  40.16 
 
 		 190 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  40.68 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  40.68 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  41.18 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  36.18 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  39.83 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  39.83 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.16 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.69 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>