152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3929 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  663    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  62.27 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  45.83 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  43.77 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  44.64 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  42.24 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  44.79 
 
 		 285 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  38.22 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  43.33 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.81 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.18 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  39.91 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  37.2 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  38.18 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.18 
 
 		 379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  38.18 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  36.11 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.15 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  31.21 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  31.21 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  35.75 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  40.66 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  39.04 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  30.87 
 
 		 397 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  39.67 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  32.17 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  37.67 
 
 		 416 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  36.52 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  38.81 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  37.25 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  37.25 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  34.98 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  37.44 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  38.53 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  37.5 
 
 		 164 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 		 180 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  39.69 
 
 		 207 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  31.17 
 
 		 390 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  43.7 
 
 		 179 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  31.56 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  37.23 
 
 		 207 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  30.35 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  35.84 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  36.21 
 
 		 199 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  30.53 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  33.89 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  44.96 
 
 		 183 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.76 
 
 		 176 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 384 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  36.93 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  41.96 
 
 		 174 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  36.93 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  39.75 
 
 		 178 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  33.33 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 199 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  44.96 
 
 		 182 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  44.96 
 
 		 182 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  36.21 
 
 		 383 aa  95.9  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 		 383 aa  95.9  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  38.1 
 
 		 231 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  44.19 
 
 		 182 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  44.19 
 
 		 182 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  40.52 
 
 		 186 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  44.19 
 
 		 182 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  44.19 
 
 		 182 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  44.19 
 
 		 182 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  44.19 
 
 		 182 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  37.06 
 
 		 184 aa  94  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  44.19 
 
 		 182 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  34.63 
 
 		 231 aa  92.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  41.73 
 
 		 178 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  41.27 
 
 		 190 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  26.23 
 
 		 404 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  42.86 
 
 		 189 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  37.69 
 
 		 184 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  40.12 
 
 		 178 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  36.51 
 
 		 173 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  34.78 
 
 		 167 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  37.69 
 
 		 184 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>