153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1960 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  87.2 
 
 		 164 aa  293  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  50 
 
 		 323 aa  140  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  43.59 
 
 		 379 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 361 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  40.38 
 
 		 379 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  40.38 
 
 		 379 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  41.61 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.57 
 
 		 392 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.82 
 
 		 379 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  39.86 
 
 		 383 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  48.23 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  39.1 
 
 		 373 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 		 325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  39.47 
 
 		 376 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  43.07 
 
 		 344 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  42.18 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  42.18 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  42.18 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  42.18 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  42.18 
 
 		 382 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  42.18 
 
 		 382 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  39.22 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  36.59 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  41.06 
 
 		 400 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 		 449 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  46.49 
 
 		 346 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  39.47 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  32.32 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  41.67 
 
 		 238 aa  107  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  44.19 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  41.79 
 
 		 416 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  43.17 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  41.35 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  35.26 
 
 		 207 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  45.28 
 
 		 378 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36.3 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  33.55 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  43.54 
 
 		 285 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  40.85 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  42.86 
 
 		 324 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  37.67 
 
 		 404 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 387 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  38.19 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  46.55 
 
 		 373 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  45.69 
 
 		 388 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 		 390 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  38.73 
 
 		 368 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  36.47 
 
 		 410 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  41.91 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  41.91 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  41.91 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  41.18 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  41.18 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  41.18 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  41.91 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  39.31 
 
 		 389 aa  98.2  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 		 376 aa  98.2  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  40.58 
 
 		 382 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  36.54 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  45.87 
 
 		 382 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  40.56 
 
 		 379 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 		 391 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  43.86 
 
 		 391 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 		 399 aa  94  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  39.55 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  42.48 
 
 		 391 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  38.3 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  43.1 
 
 		 391 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  35.58 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  33.33 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 374 aa  92  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 391 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 391 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 		 394 aa  89  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  39.34 
 
 		 404 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  36.23 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 389 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  38.89 
 
 		 377 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 389 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  34.52 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  36.36 
 
 		 391 aa  85.5  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  41.75 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 383 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  35.21 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  33.06 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  33.06 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  32.26 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  34.53 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  33.06 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  32 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.35 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  38.38 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  31.45 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>