153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0138 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  58.91 
 
 
202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  62.5 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  53.09 
 
 
199 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  49.72 
 
 
199 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  60.57 
 
 
178 aa  168  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  59.74 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  46.33 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  46.55 
 
 
231 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  51.18 
 
 
185 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  49.17 
 
 
183 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  53.93 
 
 
178 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  55.49 
 
 
178 aa  154  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  52.72 
 
 
182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  48.63 
 
 
182 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  48.63 
 
 
182 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  48.63 
 
 
182 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  49.73 
 
 
182 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  49.73 
 
 
182 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  48.63 
 
 
182 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  48.63 
 
 
182 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  48.09 
 
 
182 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  41.53 
 
 
184 aa  143  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  48.85 
 
 
174 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  43.24 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  50.64 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  44.56 
 
 
207 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  50.64 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  50.32 
 
 
188 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  42.7 
 
 
189 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  49.68 
 
 
188 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  44.51 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.07 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  45.36 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  36.93 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.07 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  36.93 
 
 
184 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  44.89 
 
 
175 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  37.99 
 
 
189 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  39.22 
 
 
180 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  51.54 
 
 
285 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 
325 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  37.91 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  47.97 
 
 
323 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  46.45 
 
 
392 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  38.32 
 
 
240 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
465 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  43.59 
 
 
382 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
397 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  43.59 
 
 
397 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
382 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  43.09 
 
 
169 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  36.67 
 
 
324 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  40.46 
 
 
173 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  43.67 
 
 
397 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  42.67 
 
 
301 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  36.72 
 
 
207 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  45.38 
 
 
346 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  42.46 
 
 
404 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  44.1 
 
 
376 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  45.34 
 
 
400 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  40.59 
 
 
238 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  45.8 
 
 
416 aa  92.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  37.8 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  39.05 
 
 
405 aa  90.5  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  39.05 
 
 
405 aa  90.5  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.46 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  37.8 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  37.8 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  40.65 
 
 
368 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  41.95 
 
 
284 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  38.58 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  38.58 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  37.8 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  39.13 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  41.52 
 
 
387 aa  88.2  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 
410 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  35.9 
 
 
379 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  36.13 
 
 
373 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  39.63 
 
 
404 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  44.17 
 
 
378 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  44.52 
 
 
391 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  44.23 
 
 
373 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  36.42 
 
 
379 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  44.52 
 
 
391 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  37.09 
 
 
383 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 
394 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  34.57 
 
 
286 aa  84  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  43.23 
 
 
399 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  39.88 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  41.4 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  37.82 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  35.19 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  35.19 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 
391 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>