152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0632 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  100 
 
 
183 aa  364  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  57.69 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  58.79 
 
 
182 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  58.79 
 
 
182 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  58.79 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  58.79 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  58.24 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  57.14 
 
 
182 aa  194  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  57.69 
 
 
182 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  57.69 
 
 
182 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  51.37 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  52.2 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  54.49 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  49.17 
 
 
179 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  51.95 
 
 
199 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  48.43 
 
 
231 aa  151  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  55.83 
 
 
175 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  44.1 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  50.33 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  52.22 
 
 
178 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  46.79 
 
 
199 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  45.3 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  43.96 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  50.65 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  42.39 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  45.93 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  44.51 
 
 
190 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  43.72 
 
 
190 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  47.26 
 
 
174 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  43.63 
 
 
202 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  43.18 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  47.02 
 
 
301 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.89 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.89 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  44.44 
 
 
379 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  40 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  42.7 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  40.52 
 
 
379 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  47.74 
 
 
189 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  44.59 
 
 
188 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  44.64 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  41.83 
 
 
361 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  43.17 
 
 
180 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  48.89 
 
 
323 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  40.52 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  44.96 
 
 
325 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  41.18 
 
 
379 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  41.18 
 
 
379 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  43.31 
 
 
188 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  36.76 
 
 
173 aa  101  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  51.18 
 
 
285 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  39.61 
 
 
378 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  40.52 
 
 
344 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  39.87 
 
 
376 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
449 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  47.11 
 
 
368 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.16 
 
 
383 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  40.91 
 
 
324 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.22 
 
 
397 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39.22 
 
 
382 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  39.22 
 
 
397 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  39.22 
 
 
397 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  39.22 
 
 
465 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39.22 
 
 
382 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  48.06 
 
 
377 aa  94.4  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  40.91 
 
 
387 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  39.07 
 
 
376 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  37.12 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.99 
 
 
373 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  39.22 
 
 
238 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  44.36 
 
 
240 aa  91.3  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  38.8 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  44.17 
 
 
346 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  44.2 
 
 
284 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  37.66 
 
 
400 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  38.01 
 
 
405 aa  90.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  38.01 
 
 
405 aa  90.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  34.55 
 
 
404 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  40.94 
 
 
416 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  39.74 
 
 
382 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  41.83 
 
 
388 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  32.74 
 
 
180 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  40 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  38.64 
 
 
391 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  39.88 
 
 
389 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 
391 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  35.59 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  37.09 
 
 
404 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  39.74 
 
 
382 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  38.95 
 
 
392 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  37.89 
 
 
399 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
391 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
373 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
391 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  30.27 
 
 
286 aa  84.7  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>