154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1921 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  100 
 
 
178 aa  348  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  60.23 
 
 
179 aa  201  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  55.93 
 
 
178 aa  184  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  54.91 
 
 
175 aa  178  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  52.53 
 
 
199 aa  174  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  52.22 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  52.22 
 
 
182 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  48.84 
 
 
194 aa  167  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  51.67 
 
 
182 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  50.26 
 
 
207 aa  167  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  51.67 
 
 
182 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  51.67 
 
 
182 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  51.67 
 
 
182 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  54.44 
 
 
182 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  51.67 
 
 
182 aa  167  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  52.22 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  52.22 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  54.44 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  47.67 
 
 
199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  48.1 
 
 
231 aa  164  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  56.57 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  49.71 
 
 
185 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  53.67 
 
 
178 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  43.33 
 
 
184 aa  155  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  49.01 
 
 
202 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  42.37 
 
 
190 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  43.58 
 
 
189 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  45.14 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  46.95 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  46.7 
 
 
190 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  45.4 
 
 
174 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.07 
 
 
184 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  56 
 
 
285 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.07 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  45 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  45.93 
 
 
164 aa  117  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.36 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  36.93 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  35.8 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  36.36 
 
 
184 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  34.66 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  34.66 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 
180 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  45.73 
 
 
188 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  41.34 
 
 
189 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  38.89 
 
 
164 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  42.29 
 
 
175 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  40.12 
 
 
325 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  46.83 
 
 
323 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  40.51 
 
 
379 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  45.09 
 
 
400 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  40.76 
 
 
379 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  41.77 
 
 
379 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  41.77 
 
 
379 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  39.89 
 
 
169 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  35.93 
 
 
324 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  41.4 
 
 
361 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  42.58 
 
 
301 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  38.17 
 
 
207 aa  101  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 
449 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  42.77 
 
 
387 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  43.31 
 
 
382 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  42.07 
 
 
397 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  42.07 
 
 
397 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  43.31 
 
 
465 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  43.31 
 
 
382 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  41.98 
 
 
238 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  41.88 
 
 
392 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  40.13 
 
 
383 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.22 
 
 
373 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  45.95 
 
 
390 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  39.33 
 
 
240 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  42.68 
 
 
397 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.89 
 
 
181 aa  97.8  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  32.22 
 
 
286 aa  96.7  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  39.63 
 
 
378 aa  95.9  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  48.76 
 
 
368 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  41.94 
 
 
391 aa  95.5  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  34.68 
 
 
376 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  44.2 
 
 
416 aa  94.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  46.83 
 
 
346 aa  94.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  45.86 
 
 
391 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  38.51 
 
 
344 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  42.58 
 
 
284 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  42.95 
 
 
388 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  45.86 
 
 
399 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 
391 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 
391 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  35.26 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 
391 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 
391 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 
391 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 
373 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  38.58 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 
405 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 
405 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  42.68 
 
 
410 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  40.62 
 
 
376 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  33.14 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>