154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0083 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  100 
 
 
182 aa  364  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  96.15 
 
 
182 aa  330  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  96.15 
 
 
182 aa  330  9e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  95.6 
 
 
182 aa  327  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  95.6 
 
 
182 aa  327  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  95.05 
 
 
182 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  94.51 
 
 
182 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  93.96 
 
 
182 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  89.56 
 
 
182 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  70.33 
 
 
182 aa  238  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  57.14 
 
 
183 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  53.55 
 
 
184 aa  201  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  53.26 
 
 
179 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  56.67 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  54.37 
 
 
199 aa  160  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  50.63 
 
 
199 aa  157  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  49.45 
 
 
178 aa  154  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  54.29 
 
 
175 aa  151  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  54.04 
 
 
194 aa  150  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  51.12 
 
 
186 aa  148  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  48.75 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  47.78 
 
 
178 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  42.86 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  47.56 
 
 
185 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  45 
 
 
189 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  41.21 
 
 
190 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  50.97 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  45.32 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  45.76 
 
 
175 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  39.44 
 
 
184 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  43.85 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  38.33 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.57 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  42.22 
 
 
176 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  39.35 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  42.33 
 
 
373 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  43.67 
 
 
301 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  38 
 
 
164 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  46.09 
 
 
325 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  41.92 
 
 
188 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  40.88 
 
 
383 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  41.48 
 
 
164 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  45.52 
 
 
323 aa  104  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  51.97 
 
 
285 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 
379 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  39.62 
 
 
379 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  39.62 
 
 
379 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 
379 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  52 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  44.59 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  38.99 
 
 
376 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  44.09 
 
 
391 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  47.93 
 
 
368 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
361 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  42.5 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  38.56 
 
 
344 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  40 
 
 
378 aa  94.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  40 
 
 
465 aa  94.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  40 
 
 
382 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  40 
 
 
397 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  40 
 
 
397 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  40 
 
 
382 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  37.5 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  40.67 
 
 
376 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.33 
 
 
397 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  39.01 
 
 
169 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  39.25 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  44.92 
 
 
346 aa  91.3  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  33.7 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  39.1 
 
 
416 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  31.43 
 
 
286 aa  88.2  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  36.08 
 
 
404 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  39.23 
 
 
324 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  39.6 
 
 
240 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.95 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  35.22 
 
 
400 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
405 aa  85.5  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
405 aa  85.5  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38 
 
 
387 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 
392 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  40.67 
 
 
390 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  39.06 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  35.12 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  35.33 
 
 
399 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  42.11 
 
 
284 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
391 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  41.55 
 
 
382 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
374 aa  81.3  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  44.07 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  41.55 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  33.54 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
373 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>