151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2943 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  62.57 
 
 
190 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  48.52 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  41.4 
 
 
184 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  41.76 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  40.32 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  40.32 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  41.76 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  42.35 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  45.91 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  42.35 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  41.76 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  43.39 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  45.57 
 
 
231 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  44.51 
 
 
174 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  44.02 
 
 
186 aa  130  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  41.99 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  42.39 
 
 
183 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  41.51 
 
 
199 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  42.7 
 
 
179 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  45.71 
 
 
175 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  40.25 
 
 
199 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  44.13 
 
 
178 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  44.03 
 
 
185 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  45.77 
 
 
188 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  47.89 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  51.22 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  47.18 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  34.73 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  40.76 
 
 
184 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  43.58 
 
 
178 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  37.82 
 
 
207 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  40.96 
 
 
175 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  45 
 
 
182 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  43.65 
 
 
182 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  44.44 
 
 
182 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  44.44 
 
 
182 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  44.44 
 
 
182 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  44.44 
 
 
182 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  43.33 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  43.89 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  43.33 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  43.05 
 
 
178 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  36.59 
 
 
379 aa  101  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  39.68 
 
 
207 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  37.2 
 
 
383 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
449 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  36.59 
 
 
379 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  34.05 
 
 
376 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  37.25 
 
 
159 aa  98.6  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  37.32 
 
 
153 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  35.53 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  37.25 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  37.25 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  35.53 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  36.59 
 
 
373 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  40.71 
 
 
156 aa  95.9  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  34.87 
 
 
159 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  41.21 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  36.91 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  34.32 
 
 
169 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  41.46 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  37.24 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  36.59 
 
 
379 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  35.97 
 
 
152 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  36.59 
 
 
379 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  34.03 
 
 
169 aa  91.3  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  40.31 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
325 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
361 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 
390 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  35.29 
 
 
344 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 
405 aa  85.9  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 
405 aa  85.9  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  38.66 
 
 
120 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 
285 aa  84.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  34.01 
 
 
178 aa  84.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  39.6 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  33.59 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  32.1 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  36.88 
 
 
376 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.2 
 
 
368 aa  81.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  40.32 
 
 
323 aa  81.6  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  40 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  33.97 
 
 
382 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  33.97 
 
 
382 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  33.97 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  33.97 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  33.97 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  35.82 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  33.54 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  35.2 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  34.62 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
397 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  32 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  39.84 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  33.89 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  42.28 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>