154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2928 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  100 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  95.21 
 
 		 188 aa  338  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  72.34 
 
 		 188 aa  274  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  72.73 
 
 		 176 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  63.79 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  66.45 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  58.76 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  49.68 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  47.18 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  39.78 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  46.49 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  38.25 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  45.83 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  43.17 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  41.4 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  42.13 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.01 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  36.84 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  44.89 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.86 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  46.75 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  36.26 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  43.95 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  48.1 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  41.67 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  52.42 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  40.56 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  43.8 
 
 		 159 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  43.8 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  43.8 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  35.75 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  42.98 
 
 		 159 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  46.79 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  39.16 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  45.73 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  40.31 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  41.04 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.76 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  46.61 
 
 		 120 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  43.94 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  41.71 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.99 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  42.86 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  49.04 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  41.58 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  40.71 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  39.78 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  39.78 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  39.78 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  39.25 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  39.25 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 		 325 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  39.25 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  39.25 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  39.35 
 
 		 405 aa  87  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  39.35 
 
 		 405 aa  87  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  37.63 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  39.25 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  42.31 
 
 		 157 aa  84.3  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  38.58 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  36.02 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  37.42 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  32.2 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  37.5 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  39.52 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  41.13 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  41.32 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  39.5 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  36.49 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  39.87 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  39.32 
 
 		 449 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  42.62 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  39.52 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.64 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  40.65 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  36.26 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  39.74 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  34.21 
 
 		 376 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  39.52 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  39.52 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  48.57 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  37.1 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  37.78 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  41.6 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  40 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 		 344 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  42.06 
 
 		 404 aa  67.8  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>