157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1745 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  353  6.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  49.43 
 
 
178 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  46.9 
 
 
153 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  45.86 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.48 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  38.86 
 
 
188 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  39.74 
 
 
190 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  37.67 
 
 
189 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  35.56 
 
 
207 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  39.87 
 
 
188 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  38.29 
 
 
188 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  38.06 
 
 
231 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  40.88 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  38.41 
 
 
394 aa  98.2  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  38.75 
 
 
194 aa  97.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  35.54 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  40.51 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  38.75 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  40.51 
 
 
159 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  36.91 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  31.9 
 
 
173 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  38.89 
 
 
156 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  39.87 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  38.75 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  38.75 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  38.4 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  38.4 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.4 
 
 
184 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  34.18 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  38.4 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  41.94 
 
 
390 aa  91.3  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  39.2 
 
 
152 aa  90.9  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  37.6 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  37.6 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  38.4 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  37.6 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  38.46 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  41.91 
 
 
392 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  35.39 
 
 
175 aa  87.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  36.08 
 
 
379 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  36.31 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  37.11 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  38.85 
 
 
404 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  36.71 
 
 
379 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  37.11 
 
 
373 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  36.71 
 
 
379 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  40 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  33.97 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  36.65 
 
 
376 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  36.6 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  34.24 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.81 
 
 
379 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  40.91 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  35.95 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  37.34 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  34.24 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.94 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  34.24 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  43.97 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  39.24 
 
 
410 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  43.97 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  33.7 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  33.7 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  42.15 
 
 
120 aa  82  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  33.7 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  33.68 
 
 
324 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  37.8 
 
 
391 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  37.97 
 
 
238 aa  81.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  33.7 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  33.7 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  39.52 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 
387 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  43.12 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  32 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
373 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  33.7 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  43.97 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  40.35 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  35.42 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  32.08 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  42.5 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  37.97 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.39 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  35.61 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  34.48 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 
376 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  45.13 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
400 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  41.29 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  32.81 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  34.73 
 
 
376 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  40.65 
 
 
382 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  37.3 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>