155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1392 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  95.6 
 
 		 159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  95.6 
 
 		 159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  80.5 
 
 		 159 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  79.25 
 
 		 159 aa  258  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  78.62 
 
 		 159 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  54.9 
 
 		 165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  50.67 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  47.79 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  43.92 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  54.7 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  45.7 
 
 		 184 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  45.03 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  45.03 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  45.03 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  45.7 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  45.03 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  41.61 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  45.03 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  44.37 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  44.37 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  46.4 
 
 		 207 aa  114  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  40.65 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  45.45 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  38.56 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  46.77 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  44.17 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  36.42 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.25 
 
 		 189 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  43.8 
 
 		 188 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  35.03 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  40.82 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  38.41 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.75 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  35.54 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  40.17 
 
 		 190 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  37.66 
 
 		 390 aa  90.5  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  37.8 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  34.42 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  39.84 
 
 		 373 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 		 394 aa  84.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  34.18 
 
 		 325 aa  84.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  37.4 
 
 		 383 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  37.25 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  33.77 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  30.87 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 379 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  34.62 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  35.44 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  33.33 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  32.58 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  34.31 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  37.5 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  35.44 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  37.98 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  36.43 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 344 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.33 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  37.41 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  33.8 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  28.85 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  38.51 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  33.12 
 
 		 376 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  37.5 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  43.88 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  36.42 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  33.59 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  33.59 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  33.59 
 
 		 379 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  38.58 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  34.64 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.15 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  31.17 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  39.22 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  35.77 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  35.77 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  30.61 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  35.77 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  35.77 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  42.37 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.54 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  30.95 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  34.81 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  34.96 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 374 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  36 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  36.67 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  33.64 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  33.64 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 		 449 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0328  HPP family protein+B94  38.68 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00996185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  32.88 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>