145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1004 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  100 
 
 		 169 aa  329  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  60.95 
 
 		 170 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  37.3 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.72 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  34.03 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  35.67 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  37.5 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  34.59 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  35.42 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  34.03 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  35.14 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  37.5 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  31.21 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  39.25 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  36.59 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  35.45 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  34.57 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  31.21 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  36.29 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  33.94 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  37.1 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  33.57 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  33.57 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  35.96 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  31.17 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  31.21 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.43 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  31.78 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  33.33 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  35 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  35.48 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  31.82 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  39.52 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  33.95 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  33.95 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  35.11 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  32.28 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  32.89 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  37.1 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  32.39 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  37.93 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  31.48 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  39.51 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  32.37 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  39.76 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  31.15 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  25.45 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  31.15 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  31.71 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  30.43 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  31.71 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  31.71 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  31.71 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  31.71 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  30.59 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  31.15 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  33.94 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  32.89 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  28.35 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  39.74 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  30.71 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  29.38 
 
 		 379 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  33.33 
 
 		 382 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 397 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  33.33 
 
 		 397 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 382 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 391 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  32.5 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 465 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  29.34 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  33.33 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 		 387 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  36.25 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  34.41 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  32.32 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  27.75 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  35.4 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  31.19 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  33 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  29.48 
 
 		 384 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>