155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6723 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  68.75 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  68.51 
 
 		 194 aa  258  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  69.59 
 
 		 199 aa  255  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  63.24 
 
 		 199 aa  254  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  51.18 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  61.04 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  50.65 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  49.71 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  52.17 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  45.4 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  47.1 
 
 		 178 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  48.41 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  46.01 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  44.03 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  42.5 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  47.41 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  47.13 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  46.67 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  46.67 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  46.67 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  46.67 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  44.57 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  45.93 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  45.93 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  45.93 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  45.09 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  45.81 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  56.45 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  47.8 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  45.18 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  38.76 
 
 		 379 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  43.9 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 		 394 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  48.1 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  47.47 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  43.09 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  43.09 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  43.09 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  43.9 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  43.09 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  39.88 
 
 		 383 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  43.09 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  40.97 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  40 
 
 		 323 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  42.28 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  39.31 
 
 		 373 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  40.97 
 
 		 164 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  42.42 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  36.42 
 
 		 449 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  39.53 
 
 		 361 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 		 392 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  37.14 
 
 		 379 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  41.95 
 
 		 400 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  38.95 
 
 		 379 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.95 
 
 		 379 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 397 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 465 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  37.5 
 
 		 382 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 397 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  37.5 
 
 		 397 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 382 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  38.85 
 
 		 391 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  43.59 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  41.77 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 		 325 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  40.25 
 
 		 368 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36.42 
 
 		 301 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  38.15 
 
 		 404 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  38.12 
 
 		 416 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 373 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  38.71 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 		 387 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  40.16 
 
 		 207 aa  94.4  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  36.36 
 
 		 286 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  40.38 
 
 		 284 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 		 410 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 		 390 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  42.19 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  36.03 
 
 		 324 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  42.29 
 
 		 389 aa  91.3  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  41.67 
 
 		 378 aa  91.3  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 		 376 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 384 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  36.54 
 
 		 388 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  38.22 
 
 		 379 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  39.23 
 
 		 346 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  36.6 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  36.77 
 
 		 384 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  32.97 
 
 		 376 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 399 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 384 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  39.62 
 
 		 382 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  39.62 
 
 		 382 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  37.18 
 
 		 240 aa  87.8  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 		 391 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 391 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  34.91 
 
 		 376 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  38.28 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 391 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>