114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0947 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  100 
 
 
178 aa  344  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  41.06 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  40.68 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  40.68 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  36.88 
 
 
184 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  35.46 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  35.46 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  33.76 
 
 
165 aa  90.9  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  36.17 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  35.46 
 
 
184 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  36.3 
 
 
159 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  35.46 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  35.46 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  34.75 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.14 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  36.3 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  34.93 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  35.62 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  34.46 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  41.09 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  40.13 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  37.93 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  34.23 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  38.98 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  30.28 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  32.26 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  35.48 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  34.48 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  38.21 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  34.81 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  36.76 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  32.39 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  37.5 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  34.43 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  38.26 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  31.82 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  35.2 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  31.25 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  39.84 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  32.41 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  29.22 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  35.19 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  35.19 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  35.44 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  27.91 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  35.65 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  32.35 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  31.4 
 
 
199 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  36.13 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  28.87 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  37.04 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  37.04 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  35.4 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  31.48 
 
 
379 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  37.17 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  36.03 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  32.08 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
325 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  31.63 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  36.03 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  27.51 
 
 
383 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  36.03 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  36.03 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  36.03 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
199 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  36.03 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  32.72 
 
 
361 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  31.48 
 
 
379 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  28.36 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  33.61 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 
390 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 
449 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  35 
 
 
373 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  29.91 
 
 
324 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  33.13 
 
 
376 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
374 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  28.29 
 
 
231 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
405 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
405 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  34.42 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  42.19 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1227  hypothetical protein  31.07 
 
 
161 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  44.3 
 
 
182 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  33.96 
 
 
378 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 
383 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  36.6 
 
 
376 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  32.81 
 
 
344 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  35.71 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  31.4 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 
285 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
392 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  30.61 
 
 
323 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
384 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
384 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  28.4 
 
 
307 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  27.88 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  25.57 
 
 
286 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  31.69 
 
 
389 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>